Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms