Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms