Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK3Q9BQ16 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms