Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms