Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms