Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms