Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms