Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRAMP1Q96RY5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms