Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALS2CR12Q96Q35 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms