Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms