Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms