Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NSMCE2Q96MF7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms