Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q96MF0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q96MF0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q96MF0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q96MF0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q96MF0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q96MF0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q96MF0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q96MF0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q96MF0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q96MF0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms