Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf85Q96MD7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms