Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms