Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX22Q96L94 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms