Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPDL1Q96EA4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms