Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C18orf8Q96DM3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms