Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms