Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms