Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPSB1Q96BD6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms