Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms