Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF12Q8WXF0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms