Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms