Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms