Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDND2Q8NHS1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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