Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATL2Q8NHH9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms