Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD53Q8N9V6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms