Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYT2Q8N9I0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT2Q8N9I0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms