Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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