Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms