Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX4Q8IY92 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX4Q8IY92 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms