Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHA9Q7RTU4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHA9Q7RTU4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHA9Q7RTU4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHA9Q7RTU4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHA9Q7RTU4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHA9Q7RTU4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHA9Q7RTU4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms