Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms