Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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