Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
METAP1DQ6UB28 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
METAP1DQ6UB28 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms