Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms