Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms