Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms