Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF123Q5XPI4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms