Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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