Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms