Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms