Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AMER1Q5JTC6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER1Q5JTC6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms