Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms