Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms