Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms