Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms