Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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