Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NDUFA9Q16795 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NDUFA9Q16795 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NDUFA9Q16795 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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